为帮忙大家更快了解最新科研进展，掌握科研热点，扩展科研思路，伯豪生物特此推出最新顶刊文献速递系列推文。本期是2024年10月最新顶刊发表的单细胞转录组相关文献集萃！
顶刊文献一 01
标题：Cancer Cell丨肿瘤内B细胞泛癌单细胞RNA-seq图谱
文章标题：A pan-cancer single-cell RNA-seq atlas of intratumoral B cells
期刊：Cancer Cell
影响因子：48.8
文章摘要：肿瘤浸润性B细胞在肿瘤的发生、发展和预后中起着重要作用，但目前缺乏一个全面的分类系统。该研究构建了首个涵盖多种癌症的肿瘤内B细胞和浆细胞的单细胞RNA测序（scRNA-seq）图谱。研究人员识别了关键的B细胞亚群特征，鉴别出十个不同的B细胞和浆细胞亚群，并揭示了它们与免疫检查点抑制剂治疗反应的关联。该研究还通过空间分析验证了图谱衍生的B细胞基因签名，并探索了B细胞与T细胞之间的独特配体-受体相互作用。此外还发布了一个公开可用的Shiny工具，使研究人员能够交互式地探索图谱数据。
顶刊文献二 02
标题：Cancer Cell丨通过CTLA4阻断能够克服肺癌脑转移中酪氨酸激酶抑制剂耐药性
文章标题：Overcoming tyrosine kinase inhibitor resistance in lung cancer brain metastasis with CTLA4 blockade
期刊：Cancer Cell
影响因子：48.8
文章概要：肺癌脑转移（LCBM）由于对酪氨酸激酶抑制剂（TKI）治疗产生的耐药性，成为临床上的重大挑战。该研究对手术获得的具有不同遗传背景和TKI治疗史的 LCBM 样本进行了单细胞 RNA 测序分析。研究发现发现酪氨酸激酶抑制剂（如奥希替尼）会重塑肺癌脑转移免疫微环境，在增加T细胞浸润的同时造成免疫检查点CTLA4的高表达，导致免疫逃逸。该研究进一步在肺癌脑转移动物模型中证实了靶向治疗和CTLA4单抗联合用药能够有效激活T细胞，克服免疫逃逸，为临床克服肺癌脑转移靶向治疗耐药问题提供了新方案。
顶刊文献三 03
标题：Nat Rev Cancer丨研究早期癌症生物学的新兴策略
文章标题：Emerging strategies to investigate the biology of early cancer
期刊：Nature Reviews Cancer
影响因子：72.5
文章概要：该综述文章系统总结了癌症发生及早期演进的最新研究进展和研究新策略，涵盖了临床样本、自发成瘤小鼠、类器官及干细胞等肿瘤早期演进研究模型，结合单细胞、空间组学和深度学习等技术，精确描绘了肿瘤早期演进过程中克隆选择、关键分子事件及影像特征。深入探讨了这些研究策略的优势和局限，并对未来发展作出展望。
顶刊文献四 04
标题：Cell丨单细胞 RNA 测序数据差异表达分析的矩量框架方法
文章标题：Method of moments framework for differential expression analysis of single-cell RNA sequencing data
期刊：Cell
影响因子：45.5
文章概要：单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据的差异表达分析对于表征实验因素如何影响基因表达分布至关重要。目前区分生物和技术来源的细胞间变异性以及评估细胞组之间定量比较的统计显著性仍然具有挑战性。该研究推出了Memento，一个用于从scRNA-seq数据中进行均值表达、变异性和基因相关性的稳健且高效的差异分析工具，能够扩展到数百万个细胞和数千个样本。Memento识别出的均值表达显著性和可重复性差异均超过现有方法，它还识别了变异性和基因相关性的差异。
顶刊文献五 05
标题：Nat Immunol丨炎症性肠病中抗肿瘤坏死因子治疗的纵向单细胞图谱
文章标题：A longitudinal single-cell atlas of anti-tumour necrosis factor treatment in inflammatory bowel disease
期刊：Nature Immunology
影响因子：27.7
文章概要：免疫介导的炎症性疾病（IMID）的精准医学需要细胞对治疗反应的理解。描述了在接受抗肿瘤坏死因子（anti-TNF）治疗的克罗恩病（CD）和溃疡性结肠炎（UC）患者中建立的治疗图谱。研究人员从216个肠道活检样本（41名受试者）生成了约100万个单细胞转录组，细分成109种细胞状态，揭示了疾病特异性差异。
顶刊文献六 06
标题：Immunity|巨噬细胞驱动儿童型高级别胶质瘤疾病发展
文章标题：Microglia and monocyte-derived macrophages drive progression of pediatric high-grade gliomas and are transcriptionally shaped by histone mutations
期刊：Immunity
影响因子：25.5
文章概要：该研究探讨了巨噬细胞在儿童型高级别胶质瘤（pHGGs）疾病发展中的作用。研究发现，弥漫性中线胶质瘤（DMGs）中的肿瘤相关巨噬细胞（TAM），包括脑内小胶质细胞和单核细胞来源的巨噬细胞，对肿瘤生长有显著影响。通过单细胞RNA测序和免疫组织化学分析，作者发现特定肿瘤驱动突变塑造了TAM的免疫浸润和转录谱。此外，趋化因子Ccl8和Ccl12在髓细胞中的表达对TAM的浸润和肿瘤进展有重要影响。研究结果表明，抑制趋化因子受体CCR1和CCR5可以有效减少TAM浸润，延长患者生存期。这些发现为pHGGs的治疗提供了新的理论依据和潜在的治疗靶点。
顶刊文献七
07
标题：Cancer Cell丨Midkine是与年龄相关和增加乳腺肿瘤发生的驱动因素
文章标题：Midkine as a driver of age-related changes and increase in mammary tumorigenesis
期刊：Cancer Cell
影响因子：48.8
文章概要：该研究通过单细胞多组学探究了大鼠乳腺中与年龄相关的变化。研究发现老年大鼠上皮增生的增加，腔特性的丧失，幼稚B细胞和T细胞的减少。此外，还发现了一种老年大鼠特有的腔祖细胞群，能够反映癌前病变，并确定Midkine（Mdk）是一种随着年龄上调的基因，是与年龄相关的腔祖细胞的调节因子。人的血液和乳腺上皮细胞中的Midkine水平随着年龄的增长而增加，而正常乳腺组织中较高的MDK与年轻女性较高的乳腺癌风险相关。研究结果揭示了衰老和肿瘤发生易感性之间的联系，并确定了Midkine是年龄依赖性乳腺肿瘤发生增加的中介。
